A estrutura de proteínas pode ser descrita a quatro níveis
Estrutura primária
Sequência de aminoácidos da cadeia polipeptídica,
indicada
do terminal amino (N-terminus) para o terminal carboxílico
(C-terminus).
Estrutura secundária Motivos tridimensionais
de fragmentos
da cadeia principal determinados por ligações de
hidrogénio
entre grupos da cadeia principal.
Estrutura terciária
Arranjo tridimensional de uma cadeia polipeptídica ( e
consequentemente
dos elementos de estrutura secundária) determinado por
interacções
entre as cadeias laterais.
Estrutura quaternária
Para proteínas constituídas por mais de uma cadeia
polipeptíca
a estrutura quaternária identifica a disposição
tridimensional
das diferentes cadeias.
Estrutura Secundária de Proteínas
A estrutura secundária de uma proteína corresponde a
regiões
localizadas de estrutura ordenada estabilizadas por ligações de hidrogénio
entre
os grupos -NH e C=O da cadeia principal
(backbone)
e em que não participam ligações de
hidrogénio
envolvendo as cadeias laterais.
Os dois tipos principais de estrutura secundária são a
hélice
alfa e a folha beta.
Hélice Alfa
A hélice alfa é uma estrutura helicoidal assegurada, como
já
referido, por ligações de
hidrogénio
entre os grupos -NH e C=O da cadeia principal
(backbone). Faça um display ribbons para ver melhor a
estrutura
em hélice.
Folha Beta
A estrutura secundária designada por folha beta é
igualmente
assegurada por ligações
de hidrogénio entre os grupos -NH e C=O da cadeia principal (backbone). Neste
exemplo
as folhas são antiparalelas (isto é estão
orientadas
em direcções opostas)
Estrutura tridimensional da Ubiquitina
A estrutura da ubiquitina ilustra os vários elementos de
estrutura
secundária, folhas beta
(antiparelas
como no exemplo anterior, em que nesta representação a
seta
indica o terminal C) e hélices alfa,
ligadas por sequências sem estrutura designadas por "random
coils"